एसएसबी प्रोटीन या प्रोटीन डीएनए एकल बैंड बाध्यकारी (अंग्रेजी से " रों कमर रों trand डीएनए ख प्रोटीन inding") प्रोटीन, जिम्मेदार स्थिर रक्षा के लिए और क्षणिक बनाए रखने के एकल डीएनए द्वैध डीएनए की जुदाई से प्राप्त बैंड हैं हेलीकॉप्टर प्रोटीन की कार्रवाई द्वारा बैंड।
एक जीव की आनुवंशिक जानकारी को डबल-बैंड डीएनए के रूप में संरक्षित और एन्कोड किया गया है। इसका अनुवाद और प्रतिकृति बनाने के लिए, यह अवांछित और अप्रभावित होना चाहिए, और यह इस प्रक्रिया में है कि एसएसबी प्रोटीन भाग लेते हैं।
32 kDa (RPA32) एक प्रतिकृति प्रोटीन का टुकड़ा एक सबयूनिट (स्रोत: जवाहर स्वामीनाथन और विकिमीडिया कॉमन्स के माध्यम से यूरोपीय जैव सूचना विज्ञान संस्थान में MSD कर्मचारी)
ये प्रोटीन सहकारी रूप से अन्य विभिन्न मोनोमर्स के साथ जुड़ते हैं जो डीएनए के साथ स्थिर होने में भाग लेते हैं और प्रोकैरियोट और यूकेरियोट्स दोनों में पाए जाते हैं।
Escherichia कोलाई SSB प्रोटीन (EcSSB) इस प्रकार का पहला प्रोटीन था जिसका वर्णन किया जाना है। ये कार्यात्मक और संरचनात्मक रूप से विशेषता थे और उनकी खोज के बाद से उन्हें प्रोटीन के इस वर्ग के लिए एक अध्ययन मॉडल के रूप में उपयोग किया गया है।
यूकेरियोटिक जीवों में बैक्टीरिया के एसएसबी प्रोटीन के समान प्रोटीन होते हैं, लेकिन यूकेरियोट्स में इन्हें आरपीए प्रोटीन या प्रतिकृति प्रोटीन ए (प्रतिकृति प्रोटीन ए) के रूप में जाना जाता है जो कार्यात्मक रूप से एसएसबी के समान होते हैं।
इसकी खोज के बाद से, विभिन्न जीवों के जीनोम की आवश्यक प्रक्रियाओं में उनकी भूमिका को स्पष्ट करने के लिए एसएसबी प्रोटीन और एकल-फंसे डीएनए के बीच बातचीत का अध्ययन करने के लिए कम्प्यूटेशनल जैव रासायनिक-कार्यात्मक मॉडलिंग का उपयोग किया गया है।
विशेषताएँ
इस प्रकार के प्रोटीन जीवन के सभी राज्यों में पाए जाते हैं और यद्यपि वे समान कार्यात्मक गुणों को साझा करते हैं, वे संरचनात्मक रूप से भिन्न होते हैं, विशेष रूप से उनके रूपात्मक परिवर्तनों के संदर्भ में, जो प्रत्येक प्रकार के एसएसबी प्रोटीन के लिए विशिष्ट प्रतीत होते हैं।
इन सभी प्रोटीनों को एक संरक्षित डोमेन को साझा करने के लिए पाया गया है जो एकल बैंड डीएनए बाइंडिंग में शामिल है और इसे ओलिगोन्यूक्लियोटाइड / ऑलिगोसेकेराइड बाध्यकारी डोमेन (ओबी डोमेन के रूप में साहित्य में पाया जाता है) के रूप में जाना जाता है।
थर्मस जलीय के रूप में थर्मोफिलिक बैक्टीरिया के एसएसबी प्रोटीन में उल्लेखनीय विशेषताएं हैं, क्योंकि उनके पास प्रत्येक सबयूनिट में दो ओबी डोमेन हैं, जबकि अधिकांश बैक्टीरिया में प्रत्येक सबयूनिट में से केवल एक है।
अधिकांश एसएसबी प्रोटीन गैर-विशेष रूप से सिंगल बैंड डीएनए से जुड़ते हैं। हालांकि, प्रत्येक एसएसबी की बाइंडिंग इसकी संरचना, सहकारिता की डिग्री, ओलिगोमेराइजेशन के स्तर और विभिन्न पर्यावरणीय परिस्थितियों पर निर्भर करती है।
डाईवैलेंट मैग्नीशियम आयनों की सांद्रता, लवणों की सान्द्रता, pH, तापमान, पॉलीमाइन, शुक्राणुनाशक और शुक्राणु की उपस्थिति, इन विट्रो में अध्ययन की गई कुछ पर्यावरणीय स्थितियां हैं जो एसएसबी प्रोटीन की गतिविधि को प्रभावित करती हैं।
संरचना
बैक्टीरिया में होमो-टेट्रामेरिक एसएसबी प्रोटीन होता है, और प्रत्येक सबयूनिट में एक ओबी बाध्यकारी डोमेन होता है। इसके विपरीत, वायरल एसएसबी प्रोटीन, विशेष रूप से कई बैक्टीरियोफेज वाले, आम तौर पर मोनो- या मंदक होते हैं।
उनके एन-टर्मिनल अंत में, एसएसबी प्रोटीन डीएनए-बाध्यकारी डोमेन के पास हैं, जबकि उनका सी-टर्मिनल अंत नौ-संरक्षित अमीनो एसिड से बना है जो प्रोटीन-प्रोटीन इंटरैक्शन के लिए जिम्मेदार है।
40, 54 और 88 पदों पर तीन ट्रिप्टोफैन अवशेष बाध्यकारी डोमेन में डीएनए के साथ बातचीत के लिए जिम्मेदार अवशेष हैं। ये न केवल डीएनए-प्रोटीन इंटरैक्शन के स्थिरीकरण को ध्यान में रखते हैं, बल्कि अन्य प्रोटीन सबयूनिट्स की भर्ती भी हैं।
ई। कोलाई के एसएसबी प्रोटीन को कम्प्यूटेशनल अध्ययन में तैयार किया गया है और यह निर्धारित किया गया है कि इसमें 74 केडीए टेट्रामिक संरचना है और यह अलग-अलग एसएसबी जैसी यूनियनों की सहकारी बातचीत की बदौलत सिंगल बैंड डीएनए को बांधता है।
आर्किया में एसएसबी प्रोटीन भी होता है। ये मोनोमेरिक हैं और एक एकल डीएनए-बाध्यकारी डोमेन या ओबी डोमेन है।
यूकेरियोट्स में, आरपीए प्रोटीन होते हैं, संरचनात्मक रूप से बोलते हैं, अधिक जटिल होते हैं: वे आरटी 70, आरपीए 32 और आरपीए 14 के रूप में जाने जाने वाले एक हेटेरोट्रीमर (तीन अलग-अलग उपनिवेशों में से) होते हैं।
उनके पास कम से कम छह ओलिगोन्यूक्लियोटाइड / ओलिगोसेकेराइड-बाध्यकारी डोमेन हैं, हालांकि वर्तमान में इनमें से केवल चार साइटें ही ज्ञात हैं: RPA70 सबयूनिट में तीन, और RPA32 सबयूनिट में रहने वाला एक चौथा।
विशेषताएं
SSB प्रोटीन में जीन के अनुरक्षण, पैकेजिंग, और संगठन में महत्वपूर्ण कार्य होते हैं, जो एक बार में फंसे हुए डीएनए स्ट्रैंड की रक्षा और उन्हें स्थिर कर देते हैं, जब वे अन्य एंजाइमों की क्रिया द्वारा उजागर होते हैं।
यह ध्यान रखना महत्वपूर्ण है कि ये प्रोटीन डीएनए स्ट्रैंड को खोलने और खोलने के लिए जिम्मेदार प्रोटीन नहीं हैं। इसका कार्य केवल डीएनए को स्थिर करने के लिए प्रतिबंधित है जब यह एकल बैंड डीएनए की स्थिति में है।
ये एसएसबी प्रोटीन सहकारी रूप से कार्य करते हैं, क्योंकि उनमें से एक संघ अन्य प्रोटीन (एसएसबी या नहीं) के मिलन की सुविधा प्रदान करता है। डीएनए की चयापचय प्रक्रियाओं में, इन प्रोटीनों को एक प्रकार का अग्रणी या प्राथमिक प्रोटीन माना जाता है।
एकल फंसे हुए डीएनए बैंड को स्थिर करने के अलावा, इन प्रोटीनों को डीएनए में बाँधने से वी। एंडोन्यूक्लाइजेस द्वारा इन अणुओं को क्षरण से बचाने का प्राथमिक कार्य होता है।
SSB- प्रकार के प्रोटीन सक्रिय रूप से लगभग सभी जीवित जीवों की डीएनए प्रतिकृति प्रक्रियाओं में भाग लेते हैं। इस तरह के प्रोटीन प्रतिकृति फोर्क अग्रिमों के रूप में आगे बढ़ते हैं, और दो पैतृक डीएनए किस्में अलग रखते हैं ताकि वे टेम्पलेट के रूप में कार्य करने के लिए उचित स्थिति में हों।
उदाहरण
बैक्टीरिया में, एसएसबी प्रोटीन आरईए प्रोटीन कार्यों को उत्तेजित और स्थिर करते हैं। यह प्रोटीन डीएनए की मरम्मत (एसओएस प्रतिक्रिया), और पूरक एकल-बैंड डीएनए अणुओं के बीच पुनर्संयोजन प्रक्रिया के लिए जिम्मेदार है।
ई। कोलाई के उत्परिवर्ती आनुवंशिक रूप से दोषपूर्ण एसएसबी प्रोटीन प्राप्त करने के लिए इंजीनियर हैं और डीएनए प्रतिकृति, मरम्मत और पुनर्संयोजन में अपने कार्यों को प्रभावी ढंग से पूरा नहीं करते हैं।
यूपीए-जैसे प्रोटीन यूकेरियोटिक कोशिकाओं में कोशिका चक्र की प्रगति को नियंत्रित करते हैं। विशेष रूप से, यह माना जाता है कि आरपीए 4 की सेलुलर एकाग्रता का डीएनए प्रतिकृति कदम पर अप्रत्यक्ष प्रभाव हो सकता है, अर्थात आरपीए 4 की उच्च सांद्रता पर यह प्रक्रिया बाधित होती है।
यह सुझाव दिया गया है कि RPA4 की अभिव्यक्ति कोशिका के प्रसार को रोक सकती है, जिससे प्रतिकृति को बाधित किया जा सकता है और पशु जीवों में स्वस्थ सेल व्यवहार्यता के रखरखाव और अंकन में भूमिका निभाई जा सकती है।
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